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    故事講述在22世紀的人類世界，一隻身份來曆不明的火恐龍橫空降落在洛小熠等六名鬥龍戰士的生活城市，相繼吸引了阿迪和六大守護龍前來人類世界，為了追蹤火恐龍真相，阿迪與鬥龍戰士被不明光圈吸到另一個空間—阿萊達星基地。鬥龍戰士在阿萊達得知火恐龍出現人類世界的原因，為了阻止這些給人類世界帶來危險的恐龍，鬥龍戰士肩負起維護正義和平使命，決定找回龍印。鬥龍戰士帶著阿萊達發明的戰鬥拍檔—寶貝龍開啟維護和平及找回龍印的旅程！

    六名戰士將各自的戰鬥拍檔烈古拉等六隻寶貝龍送回獸喚山後，卻發現人類世界出現了恐龍。受黑暗力量召喚的阿迪，來到了人類世界，在與恐龍對峙時，天空卻突然出現巨大不明漩渦洞，將阿迪以及六名戰士一同吸走了。

    阿迪和六名戰士被漩渦吸進了神奇的阿萊達星獸基地，在這，六名戰士從太古教授口中得知了人類世界出現恐龍的原因——千帆偷走了六管能發明不同類型的恐龍龍印，計劃創造全新的恐龍世界。受太古教授所托，鬥龍戰士肩負起找回龍印的任務，維護人類世界安全。

    六名戰士與六大寶貝龍成功通過了太古教授安排的考驗，正式成為了全新的拍檔，一起回到人世界開啟全新的戰鬥任務。

    回到人類世界的第一天，洛小熠卻發現原本充滿鬥龍的雷古曼卻變得懶洋洋的，什都不願意幹，奇怪的是連其他鬥龍戰士也是如此。就在洛小熠詫異時，卻無意中通過鬥龍手環發出的獨特光芒，發現了一隻來自古裂山的小惡龍——哈巴龍。

    一向有禮貌的子耀最近頻頻與同學、老師吵架，甚至還藐視其他鬥龍戰士，就在眾人百思不得其解時，又一隻來自古裂山的小惡龍——敵敵龍現身了。

    東方末發現一向自信的卡維力無緣無故變得十分自卑，經過一番觀察，發現是被來自古裂山的小恐龍——陰影龍的負能量感染了，而陰影龍的目的竟是想和東方末做朋友。

    鬥龍戰士所讀的聖龍學院宣布停課一天，原因是水災了。正當大家因為不用上學而興奮不已時，凱風卻發現了是來自古裂山的水怪龍在作怪，於是帶著加比納回到學校和水怪龍展開了較量。